Изобретение относится к медицине, биологии, экологии, а также к тем сферам деятельности, где требуется количественная оценка суммарного воздействия факторов внешней среды, а также оценка присутствия различных веществ органической и неорганической природы на структурную организацию водосодержащих систем. Технический результат - быстро и объективно количественно оценить степень структурированности исследуемой водной системы - достигается тем, что предварительно создают сверхтонкий слой исследуемой водной системы, затем полученный сверхтонкий слой исследуемой водной системы подвергают многократной инфракрасной спектрометрии с последующим определением величины критерия Махаланобиса и на основании последнего по математической зависимости: Y=-0,00000012Х 3+0,000316Х2-0,311Х+133,2, где Y - степень структурированности водной системы в условных единицах, а Х - величина критерия Махаланобиса, определяют степень структурированности исследуемой водной системы. При этом инфракрасную спектрометрию осуществляют в среднем диапазоне инфракрасного спектра через каждые 0,1-0,2 секунды. 6 з.п. ф-лы.