Изобретение относится к области медицины, в частности к гинекологии. Способ позволяет повысить информативность при прогнозе нарушений менструальной функции у девочек-подростков, неинвазивен и прост в исполнении. Методом инфракрасной спектроскопии в диапазоне длин волн, равном 1543-1425 см-1, исследуют слюну, определяют средний показатель степени пропускания инфракрасного излучения в норме (от 47,8 до 56,3%) и при значении среднего показателя степени пропускания инфракрасного излучения от 38,7 до 47,7% прогнозируют нарушения менструальной функции, выраженные же нарушения определяют при значении среднего показателя степени пропускания от 23,9 до 38,6%.