Изобретение относится к медицине, а именно к гастроэнтерологии. Сущность способа: проводят суточное мониторирование рН одновременно в четырех участках желудочно-кишечного тракта - в пищеводе, кардии, теле и антральном отделе желудка с помощью трансназального рН-метрического зонда с четырьмя измерительными электродами, при снижении рН менее 4,0 по показаниям электрода, находящегося в пищеводе, диагностируют гастроэзофагеальный рефлюкс, при рН более 4,0 по показаниям электрода, находящегося в антральном отделе желудка, определяют дуоденогастральный рефлюкс. Способ позволяет диагностировать наличие или отсутствие гастроэзофагеального и дуоденогастрального рефлюксов и назначить дифференцированное лечение по результатам одного обследования.