Изобретение относится к области медицины, а именно к онкостоматологии и лабораторной диагностике, и касается прогнозирования риска развития новообразований слизистой оболочки полости рта у лиц старше 40 лет. Сущность способа: проводят молекулярно-генетическое исследование ротовой жидкости на наличие вирусов, обладающих онкогенным потенциалом, и оценивают степень риска развития новообразований слизистой оболочки полости рта (СОПР) в совокупности с длительным стажем курения. Низкую степень риска определяют у лиц, имеющих только один фактор риска - вирус с онкогенным потенциалом или длительный стаж курения (10 лет и более), среднюю степень - при наличии одного вируса у курящего человека или двух вирусов у некурящего, высокую степень - наличие ассоциации двух вирусов и курения, либо трех и более вирусов, независимо от стажа курения, а также при выявлении ДНК ВПЧ ВКР. Способ позволяет прогнозировать риск развития новообразований СОПР, ассоциированных с вирусами, обладающими онкогенным потенциалом, на этапе донозологической диагностики и проводить корректирующие мероприятия, направленные, в частности, на элиминацию вирусов. 1 табл., 8 пр.