Изобретение относится к медицине, а именно к микробиологии, лабораторной диагностике и педиатрии, и может быть использовано для оценки уровня резистентности организма детей. Проводят молекулярно-генетическое исследование ротовой жидкости на наличие ДНК герпесвирусов: вируса Эпштейна-Барр, цитомегаловируса, герпеса 6 типа, вируса простого герпеса 1 и 2 типа. Оценивают уровень резистентности: у детей, не имеющих в микробиоте полости рта представителей герпесвирусов, определяют высокую резистентность, среднюю резистентность - при наличии одного герпесвируса, низкую резистентность - ассоциация двух и более герпесвирусов в ротовой жидкости. Способ позволяет провести оценку уровня резистентности организма детей I-II группы здоровья за счет оценки значимого комплекса вирусной компоненты микробиоты полости рта. 3 табл., 3 пр.