Изобретение относится к медицине, а именно к терапевтической стоматологии, и предназначено для использования при малоинвазивном лечении кариозных поражений и профилактики вторичного и рецидивирующего кариеса. Осуществляют инструментальную и медикаментозную обработку кариозной полости и постоянное пломбирование стеклоиономерным цементом. При этом в качестве стеклоиономерного цемента используют «Цемион», который предварительно, в тигле, смачивают раствором гидрозоля магнетита (Fe3O4) с массовой концентрацией 4 ppm, содержащим наночастицы дисперсной фазы размером 1-3 нм, в соотношении 0,33 г раствора на 1 г цемента, затем тигель со смоченным цементом высушивают в сушильном шкафу при температуре 388±2 K в течение 30 мин. После охлаждения смесь дополнительно разбавляют жидкостью марки «Цемион» в массовом соотношении 3:1 до образования однородной пасты с последующим постоянным пломбированием кариозной полости. Способ, за счет ингибирования кариесогенной микробиоты со дна и стенок сформированной кариозной полости, позволяет предотвратить развитие вторичного и рецидивирующего кариеса, сохранить целостность зуба в течение длительного периода времени и повысить качество жизни больного. 1 пр.